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text source Re: [onem] Petite formation sur les bases de données naturalistes 00413

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Le 14/12/05 14:42, =AB=A0Jean-Laurent_Hentz=A0=BB <jean-laurent.hentz@lapos=
te.net> a
=E9crit=A0:

> Par contre, je vous soumets l'id=E9e de faire un compte rendu que l'on
> pourrait proposer sur le site Onem, et ne pas h=E9siter =E0 poser des
> questions qui pourraient trouver des r=E9ponses un peu plus tard, dans
> d'autres r=E9unions ou formations.

10 personnes ont particip=E9 =E0 cette journ=E9e de formation qui c'est d=
=E9roul=E9e
en 3 parties pour =E9viter d'avoir un seul groupe important.

Bases de donn=E9es sur excel :
Le matin, nous avons principalement parler de l'utilisation d'excel, car le=
s
deux personnes pr=E9sentes =E9taient des familiers de ce logiciel. J=B9ai p=
ropos=E9
un mod=E8le de tableau de saisie avec les champs minimums suivants :

* NOM FR=20
* ou NOM LATIN=20
* DATE=20
* COMMUNE=20
* LIEUDIT=20
* PRECISION DE LIEU
* ALTITUDE=20
* OBSERVATIONS=20
* NOMBRE VU=20
* OBSERVATEUR=20
* ORIGINE DE SAISIE

Nous avons =E9voqu=E9 aussi les limites et des dangers de ce logiciel, nota=
mment
lors des tris, les donn=E9es pouvant =EAtre m=E9lang=E9es. Aussi nous avons=
fait des
petits exercices pour sauvegarder syst=E9matiquement les donn=E9es apr=E8s =
chaque
saisie. La m=E9thode propos=E9e est de faire une copie compress=E9e de la =
base
(apr=E8s chaque saisie), qui est ensuite archiv=E9e sur le disque de l=B9or=
di et
sur des CD. Au passage, j'ai retenue l'id=E9e de Cyrille (pr=E9sent l'apr=
=E8s
midi) de nommer les fichiers par date =E0 l=B9anglo-saxonne, suivi du nom d=
u
fichier (par exemple "20051217Faune.zip"), ce qui offre l'avantage de
pouvoir classer les archives dat=E9es facilement. Le principe des archives
dat=E9es permet des retours en arri=E8re en cas de perte de donn=E9es. Nous=
avons
=E9galement fait des exercices pratiques pour faire des recherches avec
l=B9outil tr=E8s performant d=B9excel appel=E9 =B3filtre automatique person=
nalis=E9=B2 et
cr=E9=E9 des =B3tableaux crois=E9s dynamiques=B2 =E0 partir de v=E9ritables=
bases de
donn=E9es existantes.
Nous avons =E9voqu=E9 =E9galement la possibilit=E9s des faire des cartes de
r=E9partition avec excel, en superposant des graphiques =B3nuages de points=
=B2 ou
=B3bulles=B2 sur une carte scann=E9e mise au fond du graphique. J=B9ai fait=
un petit
doc mode d=B9emploi sur ce sujet.
La conclusion de la matin=E9e a =E9t=E9 qu=B9excel peut =EAtre utile pour d=
es petites
bases et =E0 condition de ma=EEtriser les aides =E0 la saisie pour =E9viter=
les
erreurs de frappe sur les noms d=B9esp=E8ces ou de communes. Nous avons con=
stat=E9
que nous manquons de savoir faire sur ce dernier point.

Tous ces points ont =E9t=E9 rapidement vus avec les participants de l=B9apr=
=E8s midi
et de la soir=E9e, mais plus succinctement. Nous avons surtout travaill=E9 =
sur
les bases relationnelles sur Filemaker.

Bases =B3entre amis=B2 sur Filemaker

Le d=E9but de l=B9apr=E8s midi a =E9t=E9 consacr=E9 =E0 r=E9soudre les peti=
ts probl=E8mes de
compatibilit=E9s de la base de donn=E9es sur Filemaker 8 mac et sur pc. Nou=
s
avons vu qu=B9il y a quelques adaptations =E0 faire au niveau des polices e=
t
dans la gestion des fen=EAtres, mais a part ces d=E9tails de pr=E9sentation=
, les
deux versions sont parfaitement compatibles. Nous avons revu la question de=
s
sauvegardes dat=E9es, car si filemaker offre un peu plus de s=E9curit=E9 qu=
=B9excel,
les erreurs peuvent arriv=E9 d=B9un seul clic malheureux et sans possibilit=
=E9 de
retour, puisque ce logiciel enregistre automatiquement. La prudence est don=
c
de mise.
L=B9architecture de la base =B3entre amis=B2 est tr=E8s simple. Elle d=B9ap=
puie sur
une table principale dans laquelle toutes les saisies sont faites.
G=E9n=E9ralement, la saisie est acc=E9l=E9r=E9e en dupliquant des fiches ex=
istantes
par Pomme D (ou Ctrl D sur PC). Les tables liens sont sont que des
dictionnaires qui assurent le contr=F4le rigoureux de la saisie des noms
d=B9esp=E8ces (saisie d=B9un code de 6 lettres, 3 premi=E8res du nom de gen=
re, 3
premi=E8res du nom d=B9esp=E8ce), des noms de communes (saisie du code INSE=
E). Une
table des Lieudits est =E9galement =E0 disposition. Un menu d=E9roulant des
lieudits de la commune est ainsi disponible une fois que le code INSEE est
saisie. Ainsi dans sa version simplifi=E9e, la base =B3entre amis=B2 n=B9es=
t
compos=E9e que de quatre tables : un principale et trois dictionnaires.
Apr=E8s cette pr=E9sentation, nous avons fait un petit exercice pour import=
er
des donn=E9es dans filemaker =E0 partir d=B9un table excel et contenant de =
vrais
observations naturalistes. L=B9architecture de notre base =E9tant proche d=
=B9un
simple tableau excel, pour importer les donn=E9es, il suffit g=E9n=E9rale d=
e
compl=E9ter les tableaux que l=B9on re=E7oit en ajoutant =E0 la main les co=
des des
esp=E8ces et les codes des communes. Ce travail n=B9est pas si long.
D=B9exp=E9rience, vous savons que 4 heures sont suffisantes pour 20 000 don=
n=E9es
=B3propres=B2. Nous avons fait =E9galement l=B9exercice encore plus simple
d=B9exporter les donn=E9es de filemaker sur excel. C=B9est tr=E8s simple ca=
r
filemaker depuis la version 8 sait enregistrer directement =E0 ce format. L=
a
base =B3entre amis=B2 comprend quelques script qui permettre de cr=E9er des
rapports automatiques comme des listes d=B9esp=E8ces par communes, par site=
s ou
par d=E9partement. Les listes, b=E9n=E9ficiant d=B9un pr=E9sentation soign=
=E9es, avec
les nom en latin et en fran=E7ais, la date et les noms des derniers
observateurs ... peuvent =EAtre export=E9s en l=B9=E9tat au format PDF. C=
=B9est un
outils tr=E8s pratique de valorisation des travaux naturalistes.
Nous avons rapidement =E9chang=E9 sur les aspect d=E9ontologie, propri=E9t=
=E9 des
donn=E9es, attitude =E0 avoir vis =E0 vis des bureau d=B9=E9tude, mais sans
approfondir car ce n=B9=E9tait pas le sujet principal.

Voici donc un r=E9sum=E9 de cette journ=E9e sympathique qui c=B9est termin=
=E9e par un
petit casse cro=FBte et un verre de vin.

Bien cordialement

*********************
Jean-Michel Faton
Les Garis
F26120 LA BAUME CORNILLANE
T=E9l. perso : 04 75 60 30 03
T=E9l. bureau : 04 75 62 65 60
www.sympetrum.org

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<TITLE>Re: [onem] Petite formation sur les bases de donn&eacute;es naturali=
stes</TITLE>
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<FONT FACE=3D"Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE=3D'font-size:12.0px'>L=
e 14/12/05 14:42, &laquo;=A0Jean-Laurent_Hentz=A0&raquo; &lt;jean-laurent.h=
entz@...&gt; a &eacute;crit=A0:<BR>
<BR>
<FONT COLOR=3D"#000098">&gt; Par contre, je vous soumets l'id&eacute;e de f=
aire un compte rendu que l'on &nbsp;<BR>
&gt; pourrait proposer sur le site Onem, et ne pas h&eacute;siter &agrave; =
poser des &nbsp;<BR>
&gt; questions qui pourraient trouver des r&eacute;ponses un peu plus tard,=
dans &nbsp;<BR>
&gt; d'autres r&eacute;unions ou formations.<BR>
</FONT><BR>
10 personnes ont particip&eacute; &agrave; cette journ&eacute;e de formatio=
n qui c'est d&eacute;roul&eacute;e en 3 parties pour &eacute;viter d'avoir =
un seul groupe important.<BR>
<BR>
<U>Bases de donn&eacute;es sur excel :<BR>
</U>Le matin, nous avons principalement parler de l'utilisation d'excel, ca=
r les deux personnes pr&eacute;sentes &eacute;taient des familiers de ce lo=
giciel. J&#8217;ai propos&eacute; un mod&egrave;le de tableau de saisie ave=
c les champs minimums suivants :<BR>
<BR>
</SPAN></FONT><UL><LI><FONT FACE=3D"Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE=
=3D'font-size:12.0px'>NOM FR=20
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ont-size:12.0px'>ou NOM LATIN=20
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ont-size:12.0px'>DATE=20
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ont-size:12.0px'>COMMUNE=20
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ont-size:12.0px'>LIEUDIT=20
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ont-size:12.0px'>PRECISION DE LIEU=20
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ont-size:12.0px'>ALTITUDE=20
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ont-size:12.0px'>OBSERVATIONS=20
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ont-size:12.0px'>OBSERVATEUR=20
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ont-size:12.0px'>ORIGINE DE SAISIE<BR>
</SPAN></FONT></UL><FONT FACE=3D"Verdana, Helvetica, Arial"><SPAN STYLE=3D'=
font-size:12.0px'><BR>
Nous avons &eacute;voqu&eacute; aussi les limites et des dangers de ce logi=
ciel, notamment lors des tris, les donn&eacute;es pouvant &ecirc;tre m&eacu=
te;lang&eacute;es. Aussi nous avons fait des petits exercices pour sauvegar=
der syst&eacute;matiquement les donn&eacute;es apr&egrave;s chaque saisie. =
&nbsp;La m&eacute;thode propos&eacute;e est de faire une copie compress&eac=
ute;e de la base (apr&egrave;s chaque saisie), qui est ensuite archiv&eacut=
e;e sur le disque de l&#8217;ordi et sur des CD. Au passage, j'ai retenue l=
'id&eacute;e de Cyrille (pr&eacute;sent l'apr&egrave;s midi) de nommer les =
fichiers par date &agrave; l&#8217;anglo-saxonne, suivi du nom du fichier (=
par exemple &quot;20051217Faune.zip&quot;), ce qui offre l'avantage de pouv=
oir classer les archives dat&eacute;es facilement. Le principe des <I>archi=
ves dat&eacute;es</I> permet des retours en arri&egrave;re en cas de perte =
de donn&eacute;es. Nous avons &eacute;galement fait des exercices pratiques=
pour faire des recherches avec l&#8217;outil tr&egrave;s performant d&#821=
7;excel appel&eacute; &#8220;<I>filtre automatique personnalis&eacute;</I>&=
#8221; et cr&eacute;&eacute; des &#8220;<I>tableaux crois&eacute;s dynamiqu=
es</I>&#8221; &agrave; partir de v&eacute;ritables bases de donn&eacute;es =
existantes. <BR>
Nous avons &eacute;voqu&eacute; &eacute;galement la possibilit&eacute;s des=
faire des cartes de r&eacute;partition avec excel, en superposant des grap=
hiques &#8220;<I>nuages de points</I>&#8221; ou &#8220;<I>bulles</I>&#8221;=
sur une carte scann&eacute;e mise au fond du graphique. J&#8217;ai fait un=
petit doc mode d&#8217;emploi sur ce sujet. <BR>
La conclusion de la matin&eacute;e a &eacute;t&eacute; qu&#8217;excel peut =
&ecirc;tre utile pour des petites bases et &agrave; condition de ma&icirc;t=
riser les aides &agrave; la saisie pour &eacute;viter les erreurs de frappe=
sur les noms d&#8217;esp&egrave;ces ou de communes. Nous avons constat&eac=
ute; que nous manquons de savoir faire sur ce dernier point.<BR>
<BR>
Tous ces points ont &eacute;t&eacute; rapidement vus avec les participants =
de l&#8217;apr&egrave;s midi et de la soir&eacute;e, mais plus succinctemen=
t. Nous avons surtout travaill&eacute; sur les bases relationnelles sur Fil=
emaker.<BR>
<BR>
<U>Bases &#8220;entre amis&#8221; sur Filemaker<BR>
</U><BR>
Le d&eacute;but de l&#8217;apr&egrave;s midi a &eacute;t&eacute; consacr&ea=
cute; &agrave; r&eacute;soudre les petits probl&egrave;mes de compatibilit&=
eacute;s de la base de donn&eacute;es sur Filemaker 8 mac et sur pc. Nous a=
vons vu qu&#8217;il y a quelques adaptations &agrave; faire au niveau des p=
olices et dans la gestion des fen&ecirc;tres, mais a part ces d&eacute;tail=
s de pr&eacute;sentation, les deux versions sont parfaitement compatibles. =
Nous avons revu la question des sauvegardes dat&eacute;es, car si filemaker=
offre un peu plus de s&eacute;curit&eacute; qu&#8217;excel, les erreurs pe=
uvent arriv&eacute; d&#8217;un seul clic malheureux et sans possibilit&eacu=
te; de retour, puisque ce logiciel enregistre automatiquement. La prudence =
est donc de mise.<BR>
L&#8217;architecture de la base &#8220;entre amis&#8221; est tr&egrave;s si=
mple. Elle d&#8217;appuie sur une table principale dans laquelle toutes les=
saisies sont faites. G&eacute;n&eacute;ralement, la saisie est acc&eacute;=
l&eacute;r&eacute;e en dupliquant des fiches existantes par <I>Pomme D</I> =
(ou <I>Ctrl D</I> sur PC). Les tables liens sont sont que des dictionnaires=
qui assurent le contr&ocirc;le rigoureux de la saisie des <U>noms d&#8217;=
esp&egrave;ces</U> (saisie d&#8217;un code de 6 lettres, 3 premi&egrave;res=
du nom de genre, 3 premi&egrave;res du nom d&#8217;esp&egrave;ce), des <U>=
noms de communes</U> (saisie du code INSEE). Une <U>table des Lieudits</U> =
est &eacute;galement &agrave; disposition. Un menu d&eacute;roulant des lie=
udits de la commune est ainsi disponible une fois que le code INSEE est sai=
sie. Ainsi dans sa version simplifi&eacute;e, la base &#8220;entre amis&#82=
21; n&#8217;est compos&eacute;e que de quatre tables : un principale et tro=
is dictionnaires. <BR>
Apr&egrave;s cette pr&eacute;sentation, nous avons fait un petit exercice p=
our importer des donn&eacute;es dans filemaker &agrave; partir d&#8217;un t=
able excel et contenant de vrais observations naturalistes. L&#8217;archite=
cture de notre base &eacute;tant proche d&#8217;un simple tableau excel, po=
ur importer les donn&eacute;es, il suffit g&eacute;n&eacute;rale de compl&e=
acute;ter les tableaux que l&#8217;on re&ccedil;oit en ajoutant &agrave; la=
main les codes des esp&egrave;ces et les codes des communes. Ce travail n&=
#8217;est pas si long. D&#8217;exp&eacute;rience, vous savons que 4 heures =
sont suffisantes pour 20 000 donn&eacute;es &#8220;propres&#8221;. Nous avo=
ns fait &eacute;galement l&#8217;exercice encore plus simple d&#8217;export=
er les donn&eacute;es de filemaker sur excel. C&#8217;est tr&egrave;s simpl=
e car filemaker depuis la version 8 sait enregistrer directement &agrave; c=
e format. La base &#8220;entre amis&#8221; comprend quelques script qui per=
mettre de cr&eacute;er des rapports automatiques comme des listes d&#8217;e=
sp&egrave;ces par communes, par sites ou par d&eacute;partement. Les listes=
, b&eacute;n&eacute;ficiant d&#8217;un pr&eacute;sentation soign&eacute;es,=
avec les nom en latin et en fran&ccedil;ais, la date et les noms des derni=
ers observateurs ... peuvent &ecirc;tre export&eacute;s en l&#8217;&eacute;=
tat au format PDF. C&#8217;est un outils tr&egrave;s pratique de valorisati=
on des travaux naturalistes.<BR>
Nous avons rapidement &eacute;chang&eacute; sur les aspect d&eacute;ontolog=
ie, propri&eacute;t&eacute; des donn&eacute;es, attitude &agrave; avoir vis=
&agrave; vis des bureau d&#8217;&eacute;tude, mais sans approfondir car ce=
n&#8217;&eacute;tait pas le sujet principal.<BR>
<BR>
Voici donc un r&eacute;sum&eacute; de cette journ&eacute;e sympathique qui =
c&#8217;est termin&eacute;e par un petit casse cro&ucirc;te et un verre de =
vin. <BR>
<BR>
Bien cordialement<BR>
<BR>
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Jean-Michel Faton<BR>
Les Garis<BR>
F26120 LA BAUME CORNILLANE<BR>
T&eacute;l. perso : 04 75 60 30 03<BR>
T&eacute;l. bureau : 04 75 62 65 60<BR>
www.sympetrum.org</FONT></FONT><FONT FACE=3D"Verdana, Helvetica, Arial"><BR=
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